Badan Penanggulangan Bencana Daerah Kab Halmahera Timur di bentuk pada Tahun 2011 berdasarkan Perda Kabupaten Halmahera Timur No 30 tahun 2011 tentang Badan Penaggalungan Bencana Daerah .

Badan Penanggulangan Bencaan Daerah di pimpin oleh.

1. Kepala Pelaksanan
2. Unsur pembantu kepala pelaksana adalah Sekretaris Badan, terdiri dari ; A. Sub bagian umum dan kepegawaian. B Sub bagaian perencanaan dan evaluasi C. Sub bagian Keuangan.
3. Unsur pelaksanan adalah Bidang, terdiri dari :
4. Bidang Pencegahan dan Kesiapsiagaan;

5. - Seksi Pencegahan;

   - Seksi kesiapsiagaan.

                            2.    Bidang Darurat dan logistik , terdiri dari :

                                   - Seksi Darurat

                                   - Seksi Logistik dan Prasarana

                            3.    Bidang  Rehabilitasi dan Rekontruksi :

                                   - Seksi Rehabilitasi

                                   - Seksi Rekontruksi